حدد مجلس التعليم العالي آلية قبول الطلاب في الجامعات الخاصة، بأن يتم بعد إعلان مفاضلة يصدره مجلس الجامعة يحدد فيه الشروط والتعليمات الناظمة حيث تتناسب مع قرارات مجلس التعليم العالي والتعليمات الوزارية.
ونص القرار الذي نشرته وزارة التعليم العالي والبحث العلمي عبر موقعها الرسمين، على أن يبلّغ نسخة منه إلى مديرية المؤسسات التعليمية الخاصة قبل إعلانه عبر الموقع الإلكتروني للجامعة مع مراعاة أن يتم الإعلان بعد صدور نتائج الدورة الثانية للثانوية العامة، وأن تحدد الجامعة في الإعلان الخاص بالمفاضلة عدد المقاعد التي سيتم التفاضل عليها في كل اختصاص وأن تقوم الجامعة بإجراء مفاضلة بين المتقدمين وتعلن على موقعها الإلكتروني نتيجة المفاضلة لكل اختصاص.
وبحسب القرار يجوز للجامعة الإعلان عن مفاضلة ملء الشواغر في حال عدم استنفاد كل المقاعد المحددة ويتم القبول وفق الحدود الدنيا المعلن عنها نتيجة القبول في المفاضة الأولى لكل اختصاص، وتُجرى المفاضلة في الجامعات الخاصة بإشراف معاون الوزير لشؤون المؤسسات التعليمية الخاصة.
كما أصدر وزير التعليم العالي والبحث الدكتور بسام إبراهيم قراراً يقضي بأن يتألف مجلس الأمناء في الجامعات الخاصة من 9 أعضاء وألا يزيد على 13 عضواً على أن يحدد عددهم في النظام الداخلي للجامعة، وألا يزيد عدد المالكين على 3 أعضاء وألا يقل عدد الأكاديميين على 6 والباقي من الشخصيات العامة وأن تصدر تسميتهم بقرار من الوزير لمدة 3 سنوات قابلة للتجديد بناءً على اقتراح الجهة المالكة للجامعة.
ونص القرار على أن يكون جميع أعضاء مجلس الأمناء مواطنين سوريين، ويجوز أن يكون بينهم عرب أو أجانب إذا كانوا من المالكين وأن يكون رئيس مجلس الأمناء من الشخصيات العلمية الأكاديمية أو من الشخصيات العامة.
ويوجد في سورية مجموعة من الجامعات الخاصة والحكومية التي تقدم برامج تعليمية متنوعة تناسب عديد من الطلاب، حيث يوجد 8 جامعة حكومية، إضافةً إلى 22 جامعة خاصة.